An der Schule Klein Flottbeker Weg schätzen sie die Vielfalt aller Menschen und sehen sie als eine Bereicherung für das Lernen der Schülerinnen und Schüler an. Die Schülerinnen und Schüler lernen gemeinsam, voneinander und miteinander, wobei sie individuelle Lernwege verfolgen. Besonders legen sie in den Jahrgängen 3 und 4 einen Schwerpunkt auf musisch-ästhetische Bildung. Hier haben die Schülerinnen und Schüler die Möglichkeit, aus einem breiten Angebot an musisch-kreativen Kursen entsprechend ihren Neigungen und Interessen zu wählen.
Die Schule pflegt das Motto "Gewaltfrei Lernen" (GfL) und legt großen Wert auf einen respektvollen und verantwortungsbewussten Umgang miteinander. Sie bieten spezielle GfL-Trainings an, in denen die Schülerinnen und Schüler lernen, Konflikte auf verbale und gewaltfreie Weise zu lösen.
Der Unterricht findet in hellen und freundlichen Klassen- und Fachräumen statt, ebenso im "Leseland" (Schulbücherei) und in den großzügigen Sporthalle, die sie mit dem benachbarten
Gymnasium Othmarschen teilen. Die meisten Unterrichtsräume sind mit moderner multimedialer Ausstattung ausgestattet, neben der klassischen Kreidetafel. Zudem ist an jeden Klassenraum ein Differenzierungsraum angeschlossen. Die Vorschule verfügt über einen eigenen Gebäudetrakt mit Klassenräumen und Bereichen, in denen die Kinder kochen, basteln und spielen können.